В становлении и развитии коллектива большую роль сыграли его руководители М.Е. Ястребов, Р.Р. Ибадулин, С.С. Фролов, Ю.У. Маньков, В.А. Мясников, Г.М. Петров, В.И. Хрупкин. Большое внимание учебному заведению уделяли генерал-полковники медицинской службы Д.Д. Кувшинский, Ф.И. Комаров Э.А. Нечаев, И.М. Чиж, генерал-лейтенанты медицинской службы И.А. Юров, И.В. Синопальников, И.Ю. Быков и другие руководители военно-медицинской службы Вооруженных Сил.

Привлечение к руководству кафедрами главных военно-медицинских специалистов Минобороны генералов Э.А. Нечаева, Е.В. Гембицкого, К.М. Лисицына, В.Г. Ивашкина, П.Г. Брюсова и других подняло на новый уровень качество обучения. Ныне их успешно возглавляют главные специалисты военно-медицинской службы генерал-майоры медицинской службы А.Л. Раков, Н.А. Ефименко, П.И. Мельниченко.

При формировании учебного заведения начальниками кафедр стали профессора О.К. Гаврилов, Ю.М. Полумисков, И.И. Дерябин, И.Н. Бухаловский, Н.В Зуев. Вуз пополнялся перспективными специалистами. Молодыми офицерами в свое время пришли в коллектив профессора Е.В. Ермаков, И.В. Воронцов, К.Г. Табатадзе, Ю.Г. Шапошников, В.Г. Новоженов, А.И. Елькин, А.М. Щегольков, Н.М. Коломоец, А.И. Синопальников, А.Н, Курицын, С.А. Белков.

С созданием собственной адъюнктуры и клинической ординатуры учебное заведение получило возможности для дальнейшего подъема качества подготовки врачей и своего научно-педагогического потенциала. Опытными преподавателями стали выпускники адъюнктуры доценты Б.В. Бобий, Ю.В. Григорьев, В.Н. Давыдов, М.А. Белоногов, А.Л. Щелоков, В.В. Быстров, А.Л. Сухоруков, профессора В.Г. Белых, А.Г. Чепелев, А.Н. Курицын и другие.

В 1993 г. были образованы специализированные диссертационные советы по терапии, хирургии, организации здравоохранения.

Самым важным событием в истории вуза стало постановление Правительства России от 22 февраля 1997 г. №216 «О преобразовании военно-медицинского факультета при Российской медицинской академии последипломного образования в Государственный институт усовершенствования врачей Министерства обороны Российской Федерации».

Коллективу института одному из первых среди вузов Минобороны Министерство образования РФ выдало лицензию на право образовательной деятельности и свидетельство о государственной аккредитации.

Научной и учебно-методической работе задавала тон кропотливая работа заместителей начальника вуза А.П. Красильникова, Ю.В. Меркушина, В.В. Марюшина, Ю.Г. Дивакова, А.В. Хаблова, А.Н. Гурова, Л.В. Писаренко, офицеров учебного отдела - Ю.И. Ченцова, В.М. Поспелова, В.Г. Белых, В.П. Кошелева, В.Н. Котеленца и других. На укрепление в коллективе здорового морально-психологического климата нацелены усилия офицеров С.А. Антонюка, В.Н. Кострикова, В.Д. Ермаченкова, С.М. Гололобова, Ю.А. Корягина, Б.Я. Болкова, Л.М. Черепахина, начальников курсов и факультетов Б.М. Колотухина, А.А. Терентьева, В.А. Воробей, М.Ф. Арсеньева, В.Ю. Коптелова, В.А. Ченцова, М.Р. Малютина, И.П. Барсукова и других.

На различных этапах истории вуза обучение эффективно вели профессора В.И. Бабский, В.В. Булавин, А.Г. Брюховецкий, О.В. Воронков, И.В. Воронцов, В.А. Журавский, М.Н. Лизанец, Г.П.Лобанов, А.В. Калинин, Л.М. Клячкин, В.Д. Кучеренко, Н.М. Коломоец, Н.М. Николаев, В.Н. Преображенский, А.К. Ревский, Е.В. Решетников, Г.Г. Савицкий, Н.Ф. Сергиенко, А.И. Хазанов, В.Б. Яковлев, В.Н. Яковлев, доценты С.А, Алексанкин, Б.В. Бобий, М.Н. Виноградова, С.Ф. Гончаров, Л.М. Ермолина, И.К. Заварина, И.А. Зубков, В.Н.Давыдов, В.И. Дмитриев, В.М. Ежов, Н.Л. Кизим, Н.Н. Назаренко, А.В. Низов, Л.П. Пукач, М.И. Резник, А.П.Чернов, педагоги В.М. Азизов, В.Л. Голяков, Н.А. Комчатова, А.С. Макаренко, Т.А. Михопулос, Л.В.Першин, В.М. Строганов, И.Е. Трефильев, О.В. Якоб и другие.