По сравнению с 2012 годом масштабы акции выросли в несколько раз - 60 тысяч посетителей в этом году против 12 тысяч - в прошлом. Кроме того, в «Библионочи-2013» приняли участие Российская государственная библиотека, Историческая библиотека, Библиотека иностранной литературы, Российская государственная детская библиотека, а также Государственный Литературный музей, Культурный центр ЗИЛ, Винзавод, книжные магазины «Москва» на Воздвиженке, «Библио-Глобус», «Фаланстер», «Гиперион» и многие другие. В 2013 году РГБ отмечает свой 150-летний юбилей, и в честь этого события в рамках «Библионочи» библиотека впервые в своей истории открыла для посетителей 19-ярусное книгохранилище, в котором находятся около 33 млн единиц хранения. Экскурсанты побывали в отделе военной литературы и в знаменитом спецхране (ныне - отдел русского зарубежья) увидели коллекции книг императрицы Александры Федоровны, Петра Яковлевича Чаадаева, Николая Александровича Рубакина.
Одним из специальных проектов акции «Библионочь-2013» стал «Читательский марафон» - всероссийское читательское голосование, по итогам которого были названы имена самых популярных и читаемых в стране авторов: Виктора Пелевина, Михаила Веллера, Захара Прилепина и Бориса Акунина. На вопрос «Кто из современных писателей/поэтов попал в вашу домашнюю библиотеку?» люди называли Акунина, Пелевина, Рубину и Улицкую. «Писателем года и десятилетия» стали Людмила Улицкая, Джоан Роулинг, Борис Акунин и Виктор Пелевин, «самым удивительным произведением современной русской литературы» - «Кысь» Татьяны Толстой и «Похороните меня за плинтусом» Павла Санаева. «Главной книгой жизни» чаще всего опрошенные называли «Мастера и Маргариту» Михаила Булгакова.